生於粵劇世家的宗華（張家輝 飾）在大陸經商失敗，只好回到馬來西亞老家。他與粵劇團班主父親（林威 飾）有著長久心結，同父異母的妹妹也對他敵意甚深。但他回家不久，父親被任性的妹妹氣得病倒，眼見中元節的神功戲即將開臺，他只好在半推半就下接手家中粵劇團。幸好，有團中花旦小燕（劉心悠 飾）協助，讓劇團表現恢復以往水準。

中元酬謝鬼神的神功戲破臺開演，怪事竟接二連三發生。先是妹妹出現古怪言行，接著小燕也開始出現奇異行為，宗華自己也屢屢碰上靈異怪事，逼得他不得不裝上閉路電視觀察，竟看到讓他難以置信的影像，而這一切似乎都與劇團的當家花旦（吳家麗 飾）有關。

電影《盂蘭神功》故事發生在中元節期間，演出神功戲的粵劇團中。盂蘭節也稱為中元節，於農曆七月半展開活動，而神功戲則是在中元節期間，百姓酬神祈福的重要活動之一。「神功」的意思是「神做功德」，泛指一切因神誕、廟宇開光、鬼節打醮、太平清醮及傳統節日而上演的所有戲曲。是百姓為了酬神祈福，舉行一連串的慶祝活動之一，他們會籌集資金聘請戲班演出戲曲以「娛神娛人」及「神人共聚」，一般神功戲都在廟會或是戲臺上演出。神功戲主要是為了感謝及取悅神明，其次才讓人看，所以舞臺前的座位都空著讓神明入座觀賞，民眾則多半站在兩側看戲。

神功戲會有「破臺」儀式，多於夜間進行，避免外人觀看，戲班中人要背對臺而坐，不可觀看。粵劇戲班規定在未完成破臺儀式前，臺前臺後所有人均不準開口說話，否則不吉利。破臺儀式是演出「玄壇祭白虎」，在一張椅子上吊著一塊豬肉，讓扮老虎的演員出來吃，傳聞那塊豬肉連狗聞到也不吃。

電影中另有一重要神明「華光天王」，傳說華光天王本為火神，由於玉皇大帝覺得凡間戲棚演出太過吵鬧，便派遣華光天王去燒毀戲棚。但華光被戲棚內的表演吸引，又看到百姓們都十分喜愛戲棚內的演出，於心不忍之下，他教導百姓燒香祭拜以瞞過玉帝，逃過一場災難。

加拿大華裔女生藍可兒在2013年1月獨自到美國洛杉磯旅遊，入住塞西爾酒店 （Cecil Hotel），失踨多日後，被發現死於飯店屋頂的水塔內。因死亡地點離奇，加上她在失蹤前被監視器拍攝到在酒店電梯內做出一連串的古怪動作，讓人不寒而慄，成為全球關注焦點。此駭人影像被《盂蘭神功》編劇看見，向導演張家輝建議拍攝，但只是以電梯內恐怖情況為拍攝靈感，並非拍攝藍可兒的靈異事件。